1 juni 2023, ICI Bulletin

An elegant technology to study immune cells
Thermal peptide exchange technology. The term sounds like a simple lab protocol. But at a closer look it's a perfect example of multidisciplinary, multi-group research where a fundamental background, a good idea and an interest in technology lead to new insights and relevant medical applications. What started as an idea from the labs of Sjaak Neefjes and Huib Ovaa has now grown into a user-friendly method for screening immune cell responses to any antigen, developed in a collaboration between multiple research groups. (Image: Jolien Luimstra)

1 juni 2023, ICI Bulletin

A chemical approach to solving biological questions
UbiQ was founded in 2010 as a spin-off of the Ovaa-lab at the Netherlands Cancer Institute. The small company develops reagents for ubiquitin research and is involved occasionally in drug discovery projects, says co-founder Farid El Oualid. "Our mission is ultimately to help patients. With UbiQ, we aim to explore all possible drug targets using our technology, and to facilitate others to do their research by providing reagents."

5 december 2022, AMOLF

Dochtercellen in de darm doen wat hun moeder hen opdraagt
Onderzoekers van AMOLF hebben ontdekt hoe het kan dat cellen niet ongebreideld delen in de darm. Een idee was dat dat komt doordat er voor elke cel die deelt er gemiddeld ook een stopt met delen. Maar dit model gaf geen goed antwoord op de vraag waarom de celgroei weinig fluctueert. Jeroen van Zon en collega's ontdekten nu hoe dat kan, door time-lapse filmpjes te maken van de cellen. Ze zagen dat twee dochtercellen van een moedercel altijd hetzelfde doen. Ze delen beide wel óf beide niet. Daardoor is de celgroei constant, met minder kans op kanker en andere ziektes.(Illustratie: AMOLF)

9 mei 2022, AMOLF

First study of CRISPR-Cas defense in individual cells shows remarkable variability
Specialists in single cell dynamics of research institute AMOLF together with CRISPR-Cas researchers of TU Delft were able to measure for the first time how quickly a single cell can build new memory and remove invading DNA using the CRISPR Cas system. Remarkably, they noted a large variability between individual cells in different populations. The results were published on April 25, 2022 in the open access scientific journal Molecular Systems Biology.

7 maart 2022, AMOLF

A magic top hat for protein folding
Following a single protein inside the cavity of a GroEL chaperone for the first time, researchers at AMOLF led by professor Sander Tans discovered how protein folding can be accelerated. Amino acid chains are pulled inside the open cavity of the chaperone, where they collapse on top of themselves and fold. The findings have implications for our understanding of cellular protein control and folding diseases. The research was published in Science Advances on March 4th.

31 januari 2022, ZonMW

Eigen stamcellen maken jonge kankerpatiënten weer vruchtbaar
Jongens die chemotherapie krijgen tegen kanker zijn later vaak onvruchtbaar. Ans van Pelt ontwikkelde met steun van ZonMW een manier om uit een stukje ingevroren weefsel van hun eigen testikel stamcellen op te kweken. Bij muizen is het gelukt om deze cellen terug te plaatsen in een testikel. Deze muizen krijgen gezonde nakomelingen. Nu is de tijd aangebroken om de therapie voor mensen te ontwikkelen.

4 december 2021, AMOLF

C. elegans schakelt zijn neus voor zout niet per ongeluk uit
AMOLF-onderzoekers ontdekten in samenwerking met onderzoekers van het Erasmus MC een genetisch mechanisme dat ervoor zorgt dat een eenmaal gedifferentieerde zenuwcel zijn identiteit behoudt. Het gaat om een neuron dat zout kan detecteren in de worm C. elegans. Die identiteit wordt door een genetische schakelaar tijdens de ontwikkeling van de cel aangezet. Jeroen van Zon en collega’s ontdekten nu hoe het kan dat die schakelaar nooit meer spontaan uit gaat. Het onderzoek staat in het wetenschappelijke tijdschrift eLife.

1 februari 2019, C2W

1 februari 2019, MeMo

De uitdagingen van continue bioproductie
Bioprocestechnologie is van oudsher een batchtechnologie, waarbij cellen in een gesloten bioreactor enkele weken groeien en daarna geoogst worden. Maar sinds een aantal jaar werken fabrikanten aan het continu maken van dit proces. Met name de kolomchromatografie voor zuivering wordt aan gewerkt. Wat is er bereikt en wat zijn de uitdagingen? Experts van vier bedrijven uit het veld geven een inkijkje.

1 september 2018, Chemische Feitelijkheden

Pijnstillers - Panacee voor de pijn
Pijn zit tussen je oren. Letterlijk, want het signaal dat er ergens iets mis is in je lijf wordt in je hersenen vertaald naar ‘ik heb pijn’. En dat is maar goed ook, want pijn zorgt ervoor dat we maatregelen nemen om de oorzaak van de pijn weg te nemen of te verminderen. Maar er zijn verschillende soorten pijn, zoals bij een verwonding of ziekte, of acute en chronische pijn. Pijn is niet voor iedereen hetzelfde. Zo zijn er genetische verschillen en verschillen tussen mannen en vrouwen. Daarom zijn er veel verschillende klassen pijnstillers met ieder hun eigen werking en toepassing. De vrij verkrijgbare pijnstillers zoals paracetamol en ibuprofen kent iedereen. Werken die niet voldoende, dan grijpt de arts naar krachtiger pijnstillers zoals morfine, opioïden genoemd. Die stoffen werken meestal erg goed tegen de pijn, maar hebben grote nadelen zoals bijwerkingen en een kans op verslaving. Daarom zoeken artsen en onderzoekers naar nieuwe methoden om pijn te bestrijden en daarbij kijken ze niet alleen naar nieuwe chemische middelen.

15 december 2017, Chemische Feitelijkheden

Organen-op-een-chip - Proefpersoon op laboratoriumschaal
Een celkweek in een petrischaaltje of een proefdier is niet altijd geschikt om medicijnen op te testen. Daarom zijn sinds enkele jaren organs-on-a-chip beschikbaar. Op deze plaatjes van kunststof of silicium kunnen cellen groeien in een vrij natuurlijke omgeving, inclusief een stroom van kweekmedium voor onder andere de aan- en afvoer van essentiële stoffen. De weefsels die op deze organs-on-a-chip worden gekweekt, vaak afkomstig van stamcellen, vertonen dezelfde eigenschappen als het orgaan waar ze model voor staan. Zo is er een long op een chip die kan ‘ademhalen’ voor onderzoek naar astma en chronisch obstructieve longziekte. Met sensoren en microscopen kunnen onderzoekers kijken hoe het weefsel bijvoorbeeld reageert op een potentieel geneesmiddel. Nieuwe geneesmiddelen zijn nog niet met de techniek ontwikkeld omdat het onderzoek nog in de kinderschoenen staat. Maar de ontwikkeling van steeds kleinere chips en sensoren en doorbraken in de stamceltechnologie en DNA-technieken hebben ervoor gezorgd dat organs-on-a-chip nu klaar zijn om het ontstaan en de behandeling van ziekten mee te onderzoeken.


Veroudering - Onontkoombaar verval
Ouder worden gaat vanzelf, maar veroudering is een gecompliceerd proces. Alles wat bijdraagt aan het verval van een systeem; een mens, dier of ding, is veroudering. Slijtage, ziekte en sterven zijn onderdelen ervan. Mensen en de meeste andere organismen verouderen deels doordat onze genen niet perfect staan afgesteld. Maar we verouderen ook door pech: we staan bloot aan bijvoorbeeld zonnestraling of toxische stoffen waardoor we eerder ouder worden. En gezond leven draagt weer bij aan het vertragen van het proces.

1 maart 2016, Diversen

The challenge to bring medicines to the market
Many IMM graduates pursue a career in academia. But just as many of them venture out into an industrial career to contribute to the valorization of scientific research. Silvie Meeuwissen is one of those scientists. After a successful but fundamental PhD project she preferred the more applied research at ChemConnection, a contract research and manufacturing company. From the state of the art laboratory of the company in Oss she tells us why.
This interview appeared in the 2015 annual report of the Nijmegen Institute of Molecules and Materials (IMM).


Tissue engineering - nieuwe ledematen
Een muis met een mensenoor op zijn rug baarde eind jaren negentig opzien. Wetenschappers waren erin geslaagd een bioafbreekbare mal in de vorm van een oor te bekleden met cellen en te plaatsen onder de huid van een muis, zodat de cellen gaan groeien. Nu was dit geen echt, werkend oor, maar het principe was bewezen: het is mogelijk om cellen te laten groeien op een drager, zodanig dat ze oud of kapot weefsel kunnen vervangen en vernieuwen.

22 november 2012, NPC Highlights

Good to hear what is out there
Many NPC projects are coming to an end. The PhD students involved are about to be released onto the career market. Many of them are not sure about what to do after their graduation, as became clear when the application was opened of the BioBusiness Summerschool 2012. The summerschool introduces the students to 'the business world of Life Sciences'. As many as 70 PhDs attended the week long summerschool in Amsterdam to hear about opportunities in large companies, the possibilities to start a business and to have opportunities to extend their network.

1 april 2011, IOP

The quest for a cure for mitochondrial diseases
Jan Smeitink's purpose in life is finding a cure for mitochondrial diseases. Every year he sees hundreds of children with genetic mitochondrial defects in his clinic. The majority of the kids do not live to be adults. The energy factories of their cells, the mitochondria, fail to produce enough energy for other cellular processes. The result is a plethora of multisystem diseases. The IOP Genomics project has resulted in the development of a high-throughput screening platform for live cells using state-of-the-art imaging techniques. Hundreds of potential drugs for mitochondrial disorders can be tested using this platform. In the near future, this will lead to a cure for some of the mitochondrial diseases.
 

1 april 2010, Boeken

Bio als basis
B-Basic is een consortium van universiteiten, onderzoeksinstellingen en industrie. Vier jaar lang is onderzoek gedaan met als doel de ontwikkeling van nieuwe concepten voor het bio-based produceren in de chemische en energie-industrie. In dit boek worden de successen en lessen uitgelicht.
BMedia verzorgde de interviews met Gerrit Eggink, Helena Teles, Aukje Zimmerman, Hans Tramper, Janneke van Seters, André Faaij, Roel Bol en Ida van der Klei.

30 april 2009, Interface

Construction and data mining of chemical and biological databases
Predicting biological activity of compounds accurately is of great importance in the development of new drugs. Not only bioinformatics methods are used to predict for example receptor interaction with a drug, but also cheminformatics methods to predict the possible toxicity of a potential drug molecule. Jeroen Kazius constructed extensive databases and designed new data mining methods which can more accurately predict such activities.

1 maart 2009, IOP

Cell wall dynamics of Aspergillus Niger
Aspergillus niger, well known as the fungus that produces black mold on old bread, forms an extended network of interconnected hyphae. This mycelium has an enormous capacity to secrete proteins and other compounds. Its productivity has led the food and pharmaceutical industry to use A. niger  as the preferred biological production factories for, among others, enzymes. New information about genetic signalling in the fungus cells has urged Marc van der Maarel to study the dynamics of the A. niger mycelium in more detail.

1 februari 2009, IOP

Why some people live longer than others
Not all old people are equally old. That is, their chronological age - the number of years they have lived - is not the same as their biological age - their life expectancy and health. Some people appear to have a hereditary taint for longevity. By studying a large group of very old people, who are obviously protected from ageing and disease, researchers are trying to find these genetic variations and the biomarkers by which they are expressed.

1 februari 2009, IOP

A screening platform to understand energy metabolism
Mitochondrial disorders are a group of serious, often fatal diseases. Due to a genetic defect, the powerhouses of our cells are unable to produce enough energy from food. The mechanisms are poorly understood, let alone a therapy being available for patients. Jan Smeitink works to understand the energy metabolism in mitochondria by setting up a screening platform. This platform should generate enough knowledge to influence the energy metabolism and eventually cure disorders associated with it.

1 november 2007, Diversen

TI Pharma maakt snelle start van life sciences projecten
Tweeduizendzeven was het jaar van de start van de projecten voor het Top Instituut Pharma. Het topinstituut is in juli 2006 officieel gelanceerd. Het is uniek als zogenaamd public-private partnership waarin academia, bedrijfsleven en regulatoire instellingen samenwerken. Het doel is de efficiëntere ontwikkeling van geneesmiddelen waardoor de patiënt sneller en goedkoper genezen kan worden. Met het uitvoeren van een sterk R&D programma, het opzetten van een trainingsprogramma en het zoeken van de samenwerking buiten de grenzen werkt het topinstituut aan het vestigen van zijn naam.