15 december 2017, Chemische Feitelijkheden

Organen-op-een-chip
Een celkweek in een petrischaaltje of een proefdier is niet altijd geschikt om medicijnen op te testen. Daarom zijn sinds enkele jaren organs-on-a-chip beschikbaar. Op deze plaatjes van kunststof of silicium kunnen cellen groeien in een vrij natuurlijke omgeving, inclusief een stroom van kweekmedium voor onder andere de aan- en afvoer van essentiële stoffen. De weefsels die op deze organs-on-a-chip worden gekweekt, vaak afkomstig van stamcellen, vertonen dezelfde eigenschappen als het orgaan waar ze model voor staan. Zo is er een long op een chip die kan ‘ademhalen’ voor onderzoek naar astma en chronisch obstructieve longziekte. Met sensoren en microscopen kunnen onderzoekers kijken hoe het weefsel bijvoorbeeld reageert op een potentieel geneesmiddel. Nieuwe geneesmiddelen zijn nog niet met de techniek ontwikkeld omdat het onderzoek nog in de kinderschoenen staat. Maar de ontwikkeling van steeds kleinere chips en sensoren en doorbraken in de stamceltechnologie en DNA-technieken hebben ervoor gezorgd dat organs-on-a-chip nu klaar zijn om het ontstaan en de behandeling van ziekten mee te onderzoeken.


Veroudering - Onontkoombaar verval
Ouder worden gaat vanzelf, maar veroudering is een gecompliceerd proces. Alles wat bijdraagt aan het verval van een systeem; een mens, dier of ding, is veroudering. Slijtage, ziekte en sterven zijn onderdelen ervan. Mensen en de meeste andere organismen verouderen deels doordat onze genen niet perfect staan afgesteld. Maar we verouderen ook door pech: we staan bloot aan bijvoorbeeld zonnestraling of toxische stoffen waardoor we eerder ouder worden. En gezond leven draagt weer bij aan het vertragen van het proces.

1 maart 2016, Diversen

The challenge to bring medicines to the market
Many IMM graduates pursue a career in academia. But just as many of them venture out into an industrial career to contribute to the valorization of scientific research. Silvie Meeuwissen is one of those scientists. After a successful but fundamental PhD project she preferred the more applied research at ChemConnection, a contract research and manufacturing company. From the state of the art laboratory of the company in Oss she tells us why.
This interview appeared in the 2015 annual report of the Nijmegen Institute of Molecules and Materials (IMM).


Tissue engineering - nieuwe ledematen
Een muis met een mensenoor op zijn rug baarde eind jaren negentig opzien. Wetenschappers waren erin geslaagd een bioafbreekbare mal in de vorm van een oor te bekleden met cellen en te plaatsen onder de huid van een muis, zodat de cellen gaan groeien. Nu was dit geen echt, werkend oor, maar het principe was bewezen: het is mogelijk om cellen te laten groeien op een drager, zodanig dat ze oud of kapot weefsel kunnen vervangen en vernieuwen.

22 november 2012, NPC Highlights

Good to hear what is out there
Many NPC projects are coming to an end. The PhD students involved are about to be released onto the career market. Many of them are not sure about what to do after their graduation, as became clear when the application was opened of the BioBusiness Summerschool 2012. The summerschool introduces the students to 'the business world of Life Sciences'. As many as 70 PhDs attended the week long summerschool in Amsterdam to hear about opportunities in large companies, the possibilities to start a business and to have opportunities to extend their network.

1 april 2011, IOP

The quest for a cure for mitochondrial diseases
Jan Smeitink’s purpose in life is finding a cure for mitochondrial diseases. Every year he sees hundreds of children with genetic mitochondrial defects in his clinic. The majority of the kids do not live to be adults. The energy factories of their cells, the mitochondria, fail to produce enough energy for other cellular processes. The result is a plethora of multisystem diseases. The IOP Genomics project has resulted in the development of a high-throughput screening platform for live cells using state-of-the-art imaging techniques. Hundreds of potential drugs for mitochondrial disorders can be tested using this platform. In the near future, this will lead to a cure for some of the mitochondrial diseases.
 

1 april 2010, Boeken

Bio als basis
B-Basic is een consortium van universiteiten, onderzoeksinstellingen en industrie. Vier jaar lang is onderzoek gedaan met als doel de ontwikkeling van nieuwe concepten voor het bio-based produceren in de chemische en energie-industrie. In dit boek worden de successen en lessen uitgelicht.
BMedia verzorgde de interviews met Gerrit Eggink, Helena Teles, Aukje Zimmerman, Hans Tramper, Janneke van Seters, André Faaij, Roel Bol en Ida van der Klei.

30 april 2009, Interface

Construction and data mining of chemical and biological databases
Predicting biological activity of compounds accurately is of great importance in the development of new drugs. Not only bioinformatics methods are used to predict for example receptor interaction with a drug, but also cheminformatics methods to predict the possible toxicity of a potential drug molecule. Jeroen Kazius constructed extensive databases and designed new data mining methods which can more accurately predict such activities.

1 maart 2009, IOP

Cell wall dynamics of Aspergillus Niger
Aspergillus niger, well known as the fungus that produces black mold on old bread, forms an extended network of interconnected hyphae. This mycelium has an enormous capacity to secrete proteins and other compounds. Its productivity has led the food and pharmaceutical industry to use A. niger  as the preferred biological production factories for, among others, enzymes. New information about genetic signalling in the fungus cells has urged Marc van der Maarel to study the dynamics of the A. niger mycelium in more detail.

1 februari 2009, IOP

Why some people live longer than others
Not all old people are equally old. That is, their chronological age - the number of years they have lived - is not the same as their biological age - their life expectancy and health. Some people appear to have a hereditary taint for longevity. By studying a large group of very old people, who are obviously protected from ageing and disease, researchers are trying to find these genetic variations and the biomarkers by which they are expressed.

1 februari 2009, IOP

A screening platform to understand energy metabolism
Mitochondrial disorders are a group of serious, often fatal diseases. Due to a genetic defect, the powerhouses of our cells are unable to produce enough energy from food. The mechanisms are poorly understood, let alone a therapy being available for patients. Jan Smeitink works to understand the energy metabolism in mitochondria by setting up a screening platform. This platform should generate enough knowledge to influence the energy metabolism and eventually cure disorders associated with it.

1 november 2007, Diversen

TI Pharma maakt snelle start van life sciences projecten
Tweeduizendzeven was het jaar van de start van de projecten voor het Top Instituut Pharma. Het topinstituut is in juli 2006 officieel gelanceerd. Het is uniek als zogenaamd public-private partnership waarin academia, bedrijfsleven en regulatoire instellingen samenwerken. Het doel is de efficiëntere ontwikkeling van geneesmiddelen waardoor de patiënt sneller en goedkoper genezen kan worden. Met het uitvoeren van een sterk R&D programma, het opzetten van een trainingsprogramma en het zoeken van de samenwerking buiten de grenzen werkt het topinstituut aan het vestigen van zijn naam.


DNA sequencing - ontrafelen van de levenscode
DNA is het molecuul van het leven. De code waarin alle instructies voor onze cellen wordt geschreven bestaat uit de letters A, C, G en T: de vier basen die de bekende wenteltrapstructuur van DNA vormen. Het lezen van die code komt neer op het bepalen van de basenvolgorde, ook wel sequencing genoemd. Dit kunstje beheersen biochemici al dertig jaar. Maar dan met relatief kleine genomen of met delen van grotere genomen. Ontrafeling van het menselijke DNA met 3 miljard basenparen bleek heel wat moeilijker.

1 september 2006, Conceptuur

Let food be thy medicine
"Two-thirds of all medicine has a background in food. Research at the interface between food and pharma is important," says Dr. Johan Garssen. In a strategic alliance between Numico Research and the UIPS in Utrecht he investigates the influence of certain oligosaccharides in breast milk on the immune system. These sugars act as prebiotics and in one trial reduced the incidence of allergy in babies by half. "This group of oligosaccharides is capable of much more than we ever imagined."
 

1 september 2006, Diagned

Beslissen op basis van risicoprofilering
Een Europese megastudie wil de vraag beantwoorden of vroege detectie en behandeling van prostaatkanker de sterfte aan deze ziekte kan verminderen. Belangrijk daarbij is dat de kwaliteit van leven van de patiënten niet achteruit gaat. Een stapsgewijze risicoprofilering is één van de middelen die in deze ERSPC studie ontwikkeld zijn. "Een derde van de gevonden tumoren is ongevaarlijk. Het is onaanvaardbaar dat die wel worden behandeld."

1 augustus 2006, IOP

Dutch genomics research in good position to prosper
Prof. Dr. Arjen van Tunen stood at the cradle of the IOP Genomics programme at the dawn of the new millenium.  It was the first national Genomics research programme starting in the Netherlands. Van Tunen is content with the development of IOP Genomics since then, but urges the authorities to let go of traditional divisions: "THE industry and THE universities do not exist," van Tunen says. "Knowledge providers such as Keygene are in between. They should be acknowledged better for their merits and opportunities."